Джейсон Борн был одним из лучших агентов американских спецслужб, но тайна его прошлого не оставляла его в покое. Мужчина понятия не имел о том, кем является на самом деле и чем занимался до того момента, как потерял память. Чтобы окончательно разобраться в себе и решить стоит ли продолжать работать на спецслужбы, агент решает отправиться в отпуск и немного отдохнуть. Но спокойно решить, как продолжать жить дальше Джейсону, видимо, не суждено - уже через некоторое время после его отъезда к нему в дом явился один из его коллег...
Совсем еще зеленый агент по имени Аарон Кросс получил не слишком сложное задание, для выполнения которого не требовалось каких-то выдающихся умений или же большого опыта. Однако едва приступив к нему, юный Аарон совершил роковую ошибку, из-за которой под угрозой срыва оказалась не только сама его миссия, но и деятельность его организации в целом. Руководство порекомендовало Кроссу отыскать Борна и попытаться уговорить его помочь разобраться в случившемся. Джейсон не смог отказать неопытному сотруднику, но работать с ним сообща не смог, потому как Аарон все время пытался помочь. Вскоре Борну удается выяснить, что по вине его коллеги к могущественной террористической организации попало сверхмощное вооружение. Поэтому Джейсон внедряется в ряды террористов чтобы, изнутри помешать их злодейскому плану.